De Tsjecho‑Slowaakse Wolfhond is over het algemeen een gezond en sterk ras. Door zijn achtergrond als werkhond heeft hij een goede conditie en veel uithoudingsvermogen. Ernstige erfelijke ziekten komen relatief weinig voor.

Wel kunnen er, net als bij veel middelgrote tot grote hondenrassen, problemen voorkomen zoals heupdysplasie (een afwijking aan het heupgewricht). Ook kan het ras gevoelig zijn voor spijsverteringsproblemen en stress als er te weinig rust of structuur is.

Een goede fokker let daarom op gezondheidstesten, en als eigenaar is voldoende beweging, goede voeding en regelmatige controle bij de dierenarts belangrijk.